Natural Bridge Caverns, hoewel al op de lijst met leuke dingen om te doen in San Antonio, is nu opgenomen in het National Register of Historical Places (NRHP), een aanduiding die door het Amerikaanse ministerie van Binnenlandse Zaken is gegeven voor sites die een belangrijke rol spelen in behoud van cultuurhistorie.

In 1963 vonden ontwikkelingsgerelateerde opgravingen plaats bij Natural Bridge Caverns om de ingang te vergroten, een loopbrug aan te leggen en een wandelpad in de grot te ontwikkelen. Tijdens het oorspronkelijke graven van de ingang werden verschillende diagnostische projectielpunten geborgen die ongeveer 10.000 jaar oud waren. Bovendien werden tijdens deze ontwikkelingsfase verschillende andere stenen werktuigen teruggevonden, waaronder huidschrapers, gutsen, messen en boorfragmenten.

Medewerkers van het Texas Memorial Museum en het Vertebrate Paleontology Laboratory van de Universiteit van Texas bezochten de locatie en verzamelden aan de oppervlakte een monster van faunaresten die door de constructie waren ontdekt. Sommige exemplaren behoorden tot soorten die ongeveer 12.000 jaar geleden uitstierven.