Natural Bridge Caverns stehen zwar bereits auf der Liste der unterhaltsamen Aktivitäten in San Antonio, wurden aber nun im National Register of Historical Places (NRHP) aufgeführt, einer Auszeichnung, die das US-Innenministerium für Stätten vergibt, die eine wichtige Rolle dabei spielen Kulturgeschichte bewahren.

Im Jahr 1963 fanden entwicklungsbedingte Ausgrabungen in den Natural Bridge Caverns statt, um den Eingang zu vergrößern, einen Gehweg einzurichten und ein Wegesystem innerhalb der Höhle zu entwickeln. Bei der ursprünglichen Grabung des Eingangs wurden mehrere diagnostische Projektilpunkte geborgen, die etwa 10.000 Jahre alt sind. Darüber hinaus wurden in dieser Entwicklungsphase mehrere andere Steinwerkzeuge geborgen, darunter Hautschaber, Hohleisen, Messer und Bohrerfragmente.

Mitarbeiter des Texas Memorial Museum und des Vertebrate Paleontology Laboratory der University of Texas besuchten den Standort und sammelten an der Oberfläche eine Probe von Tierresten, die bei der Konstruktion freigelegt wurden. Einige Exemplare gehörten zu Arten, die vor etwa 12.000 Jahren ausgestorben sind.