Natural Bridge Caverns, si bien ya figuraba en la lista de cosas divertidas para hacer en San Antonio, ahora ha sido incluida en el Registro Nacional de Lugares Históricos (NRHP), una designación otorgada por el Departamento del Interior de EE. UU. para sitios que tienen un papel importante en preservación de la historia cultural.

En 1963, se llevaron a cabo excavaciones relacionadas con el desarrollo en Natural Bridge Caverns para ampliar la entrada, proporcionar una pasarela y desarrollar un sistema de senderos dentro de la caverna. Durante la excavación original de la entrada, se salvaron varias puntas de proyectil de diagnóstico que datan de aproximadamente 10.000 años. Además, se recuperaron varias otras herramientas de piedra durante esta fase de desarrollo, incluidos raspadores de piel, gubias, cuchillos y fragmentos de taladro.

El personal del Museo Conmemorativo de Texas y el Laboratorio de Paleontología de Vertebrados de la Universidad de Texas visitaron el sitio y recogieron en la superficie una muestra de restos de fauna descubiertos por la construcción. Algunos ejemplares pertenecían a especies que se extinguieron hace unos 12.000 años.